FMK understøtter pr. 27. juni 2017 begrænset ordinationsret ved at sikre at læger der har fået frataget eller indskrænket deres ordinationsret, forhindres i at ordinere og oprette recepter. Datagrundlaget for begrænset ordinationsret fås fra NSP'en hvor STPS udstiller de læger der har begrænset ordinationsret.
Forsøger en læge eller en tandlæge at foretage en af følgende handlinger vil FMK returnere en fejlbesked (465):
Øvrige handlinger skal tillades. F.eks. seponering, pausering, effektuering (registrering af udlevering/indgivelse hvor en anden læge har ordineret), medicinafstemning m.v.
Såfremt der findes eksisterende åbne, delvist udleverede eller dosisdispenserede recepter i FMK, når der tilføjes en ny registrering af begrænset ordinationsret ugyldiggøres disse ikke automatisk af FMK, men er en manuel opfølgning som STPS kan iværksætte.